我国学者一天两篇重磅论文提醒吃瓜大众最关怀的问题

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发布时间:2019-11-03 作者:责任编辑NO。魏云龙0298

植物驯化是一个长时间的进程,会导致对人类表型的杂乱表型遗传润饰。了解农作物的驯化前史能够深化了解曩昔习惯人类需求的遗传根底,并有助于进步未来的育种功率。

2019年11月2日遗传学范畴尖端学术期刊Nature Genetics杂志在线背靠背宣布了来自我国国内研讨机构两篇瓜类作物基因组研讨的最新效果。这两项研讨别离构建了甜瓜西瓜的全基因组变异图谱,提醒了这两种生果的驯化前史及果实质量的遗传分子机制

来自我国农科院基因组所黄三文团队联合我国农科院郑州果树所(榜首单位)徐永阳及西班牙巴塞罗那食物科学院JordiGarcia-Mas课题组一起通讯的题为“:A comprehensive genome variation map of melon identifies multiple domestication events and loci influencing agronomic traits的研讨论文。该研讨剖析了千余份甜瓜种质资源的基因组变异,共判定了560万个SNP。

以及北京市农林科学院(榜首单位)许勇课题组联合我国农科院郑州果树所刘文革课题组、美国康奈尔大学Boyce Thompson研讨所费章君课题组和我国农科院深圳基因组所黄三文课题组一起通讯的题为:Resequencing of 414 cultivated and wild watermelon accessions identifies selection for fruit quality traits的研讨论文。该研讨完成了完成了高质量的西瓜基因组序列图谱。

此外,鉴于这两项研讨的重要性,Nature Genetics杂志还同期配发了德国莱布尼兹植物遗传研讨所的Martin Mascher教授等人题为:Sweet genes in melon and watermelon的专评文章和以“Sweet sequencing”为题的社论文章。文章指出两项研讨使用集体基因组和数量遗传东西,提醒了驯化怎么改动西甜瓜的果实质量。

1. 来自来自我国农科院基因组所黄三文、徐永阳及西班牙JordiGarcia-Mas课题组将134个野生和1041个培养甜瓜种质进行重测序,涵盖了大部分散布,并构建了具有SNP的基因组变异图,共判定了560万个SNP。在此根底上,发现甜瓜可能发生过三次独立的驯化事情,其间一次发生在非洲区域,别的两次发生在亚洲区域并别离产生了厚皮甜瓜和薄皮甜瓜两个培养亚种。三次独立驯化“殊途同归”,都导致野生甜瓜失去了苦味和酸味并取得了甜味。此外,经过全基因组相关剖析等手法,定位了200余个与甜瓜苦味、酸味、果实巨细、果肉色彩等性状相关的候选基因和位点。此外,修改东西CRISPR–Cas9已成功应用于包含黄瓜和西瓜在内的生果作物。因而,未来有期望开发有用的基因修改以探究甜瓜的基因功能,并改进甜瓜的质量。

2. 来自北京市农林科学院许勇课题组、郑州果树所刘文革课题组、美国康奈尔大膏火章君课题组和我国农科院黄三文课题组首要选用单分子测序、光学图谱与Hi-C三维基因组联合剖析,完成了高质量的西瓜基因组序列图谱。继而,对400多份种质资源展开了基因组变异剖析,共判定近2000万个SNP。在此根底上,初次清晰了西瓜7个种之间的进化联系,发现野生黏籽西瓜是距现代培养西瓜亲缘联系最近的种群,也发现了使用野生西瓜进行抗性改进的基因组痕迹。此外,判定取得了与果实含糖量、瓤色、形状等性状相关的43个信号位点,供给了要害候选基因。

综上所述,该两项研讨提醒了甜瓜和西瓜两个密切相关物种的共性和作物进化差异,并合了人口基因组学和定量遗传学东西来研讨农作物的进化,为育种者供给了全面的育种方针。

此外,这两项研讨都标明西瓜和甜瓜都经过交融进化而失去了苦味,从而再经过不同的骤变取得甜味

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